据文献记载，明洪武四年1371年在青海省同仁县保安城西山建立了保安堡。“保安”由地名演变为民族名称。一般认为，这个家族主要是元明时期相信伊斯兰教的蒙古族。在长期的历史发展中，它吸收了一些回族、藏族、土族等。也有人认为，保安人主要是从四川、陕西等地迁往青海同仁的“回归”人发展而来。他们以驻军垦牧的形式生活在同仁的隆务河两岸。与当地东乡、撒拉、藏族等族长期交往通婚，逐步形成发展为保安族。
明末清初，保安民族社会发展，人口增加。当时保安城有100多个“番回”，城外有四屯，一干余户由土干户统治。雍正七年1729土千户王喇夫违抗清朝，川陕总督岳钟琪派兵进剿，将保安堡原募“番兵”遣散，改为“总”，改为西宁镇统辖。由兰州府管辖的乾隆二十七年1762年又隶属于循化营。同治初期，保安族因当地喇嘛教隆务寺封建主的欺压，被迫东迁。他们在循化生活了几年，然后在甘肃省积石山下的大河家和刘集定居下来。他们居住的大墩、甘梅、高李等村庄仍被习惯地称为“保安三庄”。从清末到中华民国，地方军阀马安良、马步芳一直在统治下。从1930年开始，国民党政府实行保甲制，将该地划为“两保”。
演变
同治11年2月，保安人民与回族、东乡、撒拉等民族人民一起起义，反抗清朝统治。他们在河州太子寺南部的新路坡上击败了清军。然而，由于领导起义的马占鳌最终向左宗堂投降，起义以失败告终。
保安人的名字来自原居住地保安城。保安人原居住在青海省同仁县隆务河边的保安城、下庄、加沙日，原居住在藏族。大约从元朝开始，蒙古人就进入了西北藏族。
成吉思汗于1227年攻占西夏五城兴庆府，夺得积石州后，连河州也成为蒙军的重要据点。
公元1247年，西藏萨班会冗余蒙古王子宽瑞后，蒙古军队在西藏的交流也相当频繁，保安地区已成为兵家必争的交通要道。明万历年间，青海省同仁地区设立了保安营，修建了保安城。明末清初以来，保安区形成了藏、汉、蒙古、回、土、撒拉等多民族杂居小聚居的“四寨子”——嘎撒尔、年都、吴屯、保安。同治年间，清咸丰迁至甘肃省积石山。1952年，根据国家意愿，国家正式命名为保安族，建立了以“保安三庄”为主的保安族自治乡。